2017年1月14日晚间，海南航空发布2016年12月运营数据。2016年全年海南航空（数据包括海南航空股份有限公司、中国新华航空有限责任公司、长安航空有限责任公司、山西航空有限责任公司、云南祥鹏航空有限责任公司、福州航空有限责任公司和乌鲁木齐航空有限责任公司的生产运输统计数据）客运量4628.925万人次，同比增长19.93%。全年客座率87.81%，比上年降低0.38个百分点。截至2016年12月底，海航合计运营238架飞机。
从国内航线客运量角度观察，暑期、农历新年、小长假所在的10月仍是客运高峰。5月、6月客运量与客座率均处于全年较低水平。2016年7月客运增速达到全年最高水平，随后几个月逐渐放缓，2016年12月客运量增速为全年最低。总体而言，国内航线客运量增速与客座率在行业内属于较高水平。
2016年受内地居民赴香港、台湾地区明显放缓的影响。海航地区航线客运量与客座率在2016年下半年出现明显的下滑。2016年全年海航地区航线客运量28.84万人次，同比微增3.61%。全年客座率79.36%，减少3.25个百分点。
2016年海航仍在国际化道路上不断前进。全年客运量226.898万人次，同比增长64.31%。全年客座率80.01%，比上年降低1.19个百分点。2015年11月海航国际航线客座率曾跌破70%，2016年全年波动趋势放缓，但11月仍是全年的低谷。从全年的月度客运量观察，暑期仍是全年客运量高峰。
2016年6月起海航发布国际航线开航情况：
2016年6月10日，新增北京-曼彻斯特航线（每周4班）；6月30日起，新增北京-卡尔加里航线（每周3班）。
2016年9月14日起，新增西安-悉尼航线（每周2班）；9月12日起，新增长沙-悉尼航线（每周2班）；9月22日起，新增广州-岘港航线（每周2班）。
2016年10月31日起，新增海口-岘港航线（每周2班）。
2016年11月1日起，新增海口-河内航线（每周3班）；11月8日起，新增西安-墨尔本航线（每周2班）；11月9日起，新增长沙-墨尔本航线（每周2班）；11月28日起，新增深圳-岘港航线（每周2班）。
2016年12月17日起，新增深圳-普吉航线（每周2班）；12月18日起，新增深圳-芽庄航线（每周4班）；12月26日起，新增广州-芽庄航线（每周5班）；12月29日起，新增深圳-奥克兰航线（每周2班）；12月30日起，新增海口-琅勃拉邦航线（每周1班）；12月30日起，新增三亚-金边航线（每周2班）；12月31日起，新增深圳-清迈航线（每周3班）。
2016年海航选择的国内始发机场主要集中在北京、西安、长沙、广州、海口、深圳。侧面亦可看出海航对于上述市场的重视。相较于2015年，2016年海航顺应出境需求，开通多条东南亚航线，也弥补了以往航线网络的薄弱之处。
展望2017年，手握多架宽体机订单的海航应会继续坚持国际化战略，开通多条国际航线。但随着国际航线数量的不断增长，海航如何增强国际航线尤其中远程国际航线竞争力，将新增运力与市场需求同步消化仍值得观察。